Efter 11. september 2001 blev sikkerhedskravene skærpet verden over. Bl.a. gennemførte den Internationale Maritime Organisation, IMO, en omfattende analyse, som udmundede i et regelsæt med det hovedformål at forebygge terrorhandlinger mod skibe og havne. Regelsættet kaldes ISPS (International Ship & port Facility Security Code) og består af 3 sikringsniveauer. CMP er på niveau 1 og kan ændre niveau i løbet af kort tid, hvis der opstår en situation, der kræver højere security.
Sikringsklassificeringen betød, at CMP måtte optimere sin daværende sikkerhedssystem og -procedurer, og man valgte i den forbindelse at installere det integrerede sikkerhedssystem Bewator 2010. Alle bygninger, indgange og porte er sikret med systemet, som giver mulighed for central overvågning af en række lokaliteter, der ikke er geografisk tilknyttede. Således er det muligt at sikre havneterminalerne i både København og Malmø i ét og samme system, der via netværk sørger for, at det højeste sikringsniveau opretholdes.
Al adgang til CMPs faciliteter sker via kort, der aflæses af Bewator 2010 systemets læsere. Adgangen overvåges centralt, hvilket bl.a. giver mulighed for at holde styr på, hvem der passerer ind og ud af havnens faciliteter, og hvornår. Desuden giver Bewator 2010 systemet overblik over de mange daglige aktiviteter samt den betragtelige trafik ind og ud af havnen.
CMPs administrations- og personalebygning ligger udformet som et containerskib ved kajen i Orientbassin i Københavns Havn med udsigt over containerterminalen. Bygningen udgør en del af afgrænsningen til Frihavnen og er konstrueret, så ISPS kravene er fuldt integreret i bygningen.
Alle havnens administrative og produktionsrettede funktioner er samlet i hovedbygningen. De tre øverste etager er forbeholdt administration, mens stueetagen råder over Checkpoint og havnekontoret, hvor lastbiler tjekker ind, og hvor skibstrafikken i København og Malmö overvåges. Desuden er kantinen og en række af havnearbejdernes faciliteter en del af bygningen.
Bewator 2010 systemet i København/Malmö havn er leveret af Bewator AB og Bewator Antech A/S. I hovedbygningen er systemet installeret af Jape Teknik Aps, Certificeret Bewator 2010 partner.